實時熒光定量PCR系統可檢測低至1.5倍的基因表達差異。該系統支持廣泛的基因組學應用，例如分析基因表達、microRNA和非編碼RNA、拷貝數變異、藥物代謝酶和蛋白質表達、SNP基因分型以及突變檢測。
qPCR Cycle Check試劑盒是用于檢查驗證熒光定量PCR儀的有力工具。它通過對溫度敏感的PCR反應來監測熒光定量PCR儀的溫度變化。它采用的引物/探針的序列經巧妙設計，能夠對溫控偏差、溫度均一性、溫度準確性和耗時極為敏感。溫度偏差超過2℃，qPCR的擴增反應即完全停止。它采用常規的qPCR程序，模板的濃度也經過預先設計，只有在qPCR高效時才進行擴增。
常見故障：
個別孔擴增效率差異很大，可能的原因是半導體模塊出現壞點。
熒光染料污染樣品孔。
PCR管融化，原因可能是溫度傳感器出問題或是熱蓋出問題。
儀器工作時出現噪音。
熒光強度減弱或不穩定，產生的原因有濾光片發霉或有水汽，或光源損耗（以鹵鎢燈為光源的），需更換光源；或需調節檢測元件靈敏度。
開機黑屏。
開機錯誤模式。
開機報黃燈。
濾光轉輪報錯。
擴增曲線不均一。
